你說的應(yīng)該是野豬(Sus scrofa)的基因組
從以下鏈接的圖中可以看到complement那段說的就是一個基因名字為LOC100622239,這個基因的特點就是,相對GUCY1A3而言,它是向另一個方向轉(zhuǎn)錄合成mRNA,同時其基因的一部分與GUCY1A3有重疊.基本上由于轉(zhuǎn)錄方向不同,模板DNA鏈也就不同,所以LOC100622239與GUCY1A3不可能是同一個基因.
另外值得一提的就是LOC100622239是一個預(yù)測的基因,也就是說因為其序列與已知基因有一定的相似性,所以從信息學(xué)的角度預(yù)測它可能也可以轉(zhuǎn)錄翻譯,但是目前沒有任何實驗證據(jù).
簡而言之,我的回答就是這 complement(50961..>71020)可能是另外一個轉(zhuǎn)錄本,但不是GUCY1A3這個基因.
請問下這個NCBI序列怎么看?
請問下這個NCBI序列怎么看?
gene 1..>71020
/gene="GUCY1A3"
/note="Derived by automated computational analysis using
gene prediction method:BestRefseq."
/db_xref="GeneID:553100"
gene complement(50961..>71020)
/gene="LOC100622239"
/note="Derived by automated computational analysis using
gene prediction method:GNOMON.Supporting evidence
includes similarity to:3 ESTs,2 Proteins"
/db_xref="GeneID:100622239"
我想問的是后面那個 complement(50961..>71020)是什么意思?相比與前面的 1..>71020.是不是說這 complement(50961..>71020)是基因的另外一個轉(zhuǎn)錄本?
gene 1..>71020
/gene="GUCY1A3"
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gene prediction method:BestRefseq."
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gene complement(50961..>71020)
/gene="LOC100622239"
/note="Derived by automated computational analysis using
gene prediction method:GNOMON.Supporting evidence
includes similarity to:3 ESTs,2 Proteins"
/db_xref="GeneID:100622239"
我想問的是后面那個 complement(50961..>71020)是什么意思?相比與前面的 1..>71020.是不是說這 complement(50961..>71020)是基因的另外一個轉(zhuǎn)錄本?
語文人氣：916 ℃時間：2020-05-24 13:27:43
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