原核生物轉錄的終止有兩種機制.一是需要蛋白質因子ρ（Rho）的參與,ρ因子能與轉錄中的RNA結合,啟動ρ因子ATP酶活性,并向RNA的3’端滑動,劃至RNA附近時,RNA聚合酶暫停聚合活動,使RNA:DNA解鏈分離轉錄的RNA釋放種植轉錄.
另一是在立體系統中發(fā)現的,純化的的RNA聚合酶不需要其他蛋白質因子的參與,可使轉錄終止,即不依賴ρ因子的轉錄終止機制,模板DAN在轉錄終止點附近有特殊核苷酸序列可以形成頸環(huán)結構影響RNA聚合酶的構象使轉錄暫停,DAN與RNA雙鏈不穩(wěn)定分離,轉錄終止.
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