所謂的堿基堆積力是指在DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)中,堿基對平面垂直于中心軸,層疊于雙螺旋的內(nèi)側(cè),相鄰疏水性堿基在旋進(jìn)中彼此堆積在一起相互吸引形成的作用力.雙鏈DNA中的堿基比單鏈DNA中堿基的堆積程度高,是由兩條鏈配對堿基間的氫鍵引起的.所有的堿基都指向正確方向時(shí),達(dá)到最大的氫鍵鍵合.已經(jīng)被堆積的堿基更容易鍵合,已經(jīng)被氫鍵定向的堿基更容易堆積.氫鍵和堿基堆積是一致的,兩者是一種協(xié)同作用,處于中間的堿基比兩邊的堿基穩(wěn)定.
從嘌呤到嘧啶方向的堿基堆積作用大于從嘧啶到嘌呤方向的堿基堆積作用.
疏水相互作用力,簡稱疏水力,它不是討論分子間的相互作用力,主要是討論吸附力,是討論溶劑對溶質(zhì)的作用.確切地說,是溶劑分子對溶質(zhì)分子產(chǎn)生的力,與分離過程中的分子平衡研究對象相同,屬微觀過程,但這種微觀過程的變化又會(huì)引起宏觀熱力學(xué)量的改變.
所以可以看出,堿基堆積力是因?yàn)閴A基的疏水性而緊密堆積從而形成的一種力,以維持DNA的結(jié)構(gòu).而疏水作用則和分子本身水分子之間的一種力的關(guān)系.