不同地質時代的灰?guī)r含有不同的化石及化石組合.不同環(huán)境成因的灰?guī)r含有不同的化石及化石組合.世界上絕大多數灰?guī)r都是海相灰?guī)r,即在淺海環(huán)境下沉積而成,少數為淡水灰?guī)r,多為湖湘.
常見的化石有三葉蟲、蜓類、腕足類、牙形石（肉眼不可見）、海百合、角石、珊瑚等等（還有很多）.