從功能上看,細胞內膜結合細胞器的分布是功能越重要越靠近中央; 從層次看,上游的靠內,下游的靠外.如細胞核位于細胞的中央,它是細胞中最重要的細胞器,有兩層膜結構.細胞核的外膜與內質網(wǎng)的膜是聯(lián)系在一起的,細胞核的外膜是粗面內質網(wǎng)的一部分.粗面內質網(wǎng)的功能是參與蛋白質合成,其作用僅次于細胞核,所以內質網(wǎng)位于細胞核的外側.高爾基體在內質網(wǎng)的外側,接受來自內質網(wǎng)的蛋白質和脂肪,然后對它們進行修飾和分選,它所完成的是內質網(wǎng)的下游工作.溶酶體是含有水解酶的囊泡,它是由高爾基體分泌而來.內體是由內吞作用產(chǎn)生的具有分選作用的細胞器,它能向溶酶體傳遞從細胞外攝取的物質,這種細胞器一般位于細胞質的外側.另外還有線粒體、過氧化物酶體等分布在細胞的不同部位.