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  • 用qRT-PCR測(cè)某轉(zhuǎn)錄因子的mRNA,該蛋白具有三種不同亞型,引物要如何設(shè)計(jì)

    用qRT-PCR測(cè)某轉(zhuǎn)錄因子的mRNA,該蛋白具有三種不同亞型,引物要如何設(shè)計(jì)
    我要測(cè)某轉(zhuǎn)錄因子Sc,S有三個(gè)亞型abc,但一般報(bào)道里見(jiàn)ac較多.NCBI上只找的到同屬種的1和2變體,不知道是該用其中一個(gè)來(lái)設(shè)計(jì)引物呢,還是要拿共同區(qū)段來(lái)設(shè)計(jì)引物.
    網(wǎng)上說(shuō)ac的區(qū)別在于翻譯的起始位點(diǎn)不同.
    另外,如果序列相同,但是蛋白空間結(jié)構(gòu)不同的話,qRT-PCR能測(cè)出不同的亞型嗎?
    生物人氣:325 ℃時(shí)間:2020-07-19 03:24:03
    優(yōu)質(zhì)解答
    這個(gè)我和很久以前的一個(gè)課題很接近啊.
    首先,你要很明確你用來(lái)做實(shí)驗(yàn)的細(xì)胞這三種亞型都有充分的表達(dá),或者某種細(xì)胞系,某種亞型的表達(dá)高.
    然后,如果只是翻譯位點(diǎn)不同的話,那就和PCR無(wú)關(guān)了,應(yīng)該改用western,可以測(cè)到不同的蛋白(一大一?。?你這么會(huì)想到要用PCR來(lái)區(qū)分這個(gè)呢,基礎(chǔ)知識(shí)實(shí)在太差了.
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