高中階段的微生物分類可以有以下幾種：
1、按照結(jié)構(gòu)特點分類：
（1）真核生物,有以核膜包被的細胞核,核中的DNA與蛋白質(zhì)結(jié)合在一起形成染色體,且細胞中含有各種細胞器.例如如酵母菌、霉菌、真菌（如蘑菇）；
（2）原核生物：細胞無核膜包被的細胞核,稱為擬核,擬核中的DNA不與蛋白質(zhì)結(jié)合形成染色體,且只有核糖體一種細胞器；
（3）病毒：如噬菌體、煙草花葉病毒等,病毒無細胞結(jié)構(gòu),無獨立代謝系統(tǒng),只能依賴于活細胞生存.
2、按照代謝類型分為自養(yǎng)需氧生物、異養(yǎng)需氧型、自養(yǎng)厭氧型和異養(yǎng)厭氧型.
3、按照在生態(tài)系統(tǒng)中的功能劃分則分為生產(chǎn)者（如化能合成菌）、消費者（寄生的細菌、真菌或病毒等）、分解者（腐生細菌、真菌等）