一個脫氧核苷酸分子是由一個磷酸分子,一個脫氧核糖,一個堿基組成的.相鄰的兩個脫氧核苷酸之間是這樣的結(jié)構(gòu)：脫氧核糖的3`－磷酸－5`－脫氧核糖的4`.（“－”是指磷酸二酯鍵.3`是指其中一個脫氧核苷酸的五碳糖3號位置,5`是指另外一個脫氧核苷酸五碳糖的五號位置.DNA單鏈的斷開是在3`－磷酸之間的磷酸二酯鍵斷開的；DNA單鏈形成時又會在3`與磷酸之間通過脫水形成磷酸二酯鍵.相鄰的脫氧核苷酸分子不斷這樣連接,于是形成了單鏈.而一個DNA分子的合成,是由兩條單鏈的DNA通過堿基互補(bǔ)配對形成的,堿基之間同時會形成氫鍵.