無菌檢查是檢查是否有活微生物存在的一種方法；,微生物限度檢查是檢查活微生物數(shù)是否超出規(guī)定限度的一種方法.由此可見兩者是有區(qū)別的.無菌檢查控制較嚴格,不允許論何活微生物存在；微生物限度檢查只要求活微生物數(shù)控制在一定限度范圍之內,即可.
在藥品控制上,《中國藥典》2010年版規(guī)定：
無菌檢查用于注射劑、滴眼劑等藥物的檢查,并且檢查培養(yǎng)時間為14天.微生物限度檢查用于片劑、口服液等制劑的檢查,細菌培養(yǎng)3天.霉菌、酵母菌培養(yǎng)5天.口服給藥制劑細菌數(shù)不得過100cfu/mL,或1000cfu/g；霉菌和酵母菌數(shù)不得過100cfu/m L(或)g.
相同之處,無菌檢查、微生物限度檢查勻應在環(huán)境潔凈度10000級下的局部潔凈度100級的無菌室內進行操作.