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  • 水稻純度鑒定 DNA分析方法 使用哪個(gè)SSR引物,只用一對(duì)還是幾對(duì)還是全部?

    水稻純度鑒定 DNA分析方法 使用哪個(gè)SSR引物,只用一對(duì)還是幾對(duì)還是全部?
    生物人氣:513 ℃時(shí)間:2020-05-19 19:10:43
    優(yōu)質(zhì)解答
    一般純度鑒定都是針對(duì)一個(gè)基因或一個(gè)區(qū)域的,這時(shí),針對(duì)目標(biāo)位置設(shè)置一對(duì)SSR引物即可.對(duì)于沒(méi)有設(shè)定特定位點(diǎn)的檢測(cè),因?yàn)樵谝粋€(gè)位置可能是一個(gè)純度,但不代表另一個(gè)位置也是這個(gè)純度,此時(shí),當(dāng)然是多用SSR引物對(duì)了.GB/T20396-2006說(shuō)的選用12對(duì)引物,這12對(duì)引物同時(shí)加入一個(gè)PCR管,還是只能一對(duì)加入一個(gè)PCR管,如果是12對(duì)那么一粒種子就要做12個(gè)PCR管?應(yīng)該是一個(gè)PCR管加一對(duì)引物!其實(shí)對(duì)于檢測(cè)來(lái)說(shuō),做12個(gè)PCR也不算麻煩,畢竟只是個(gè)PCR時(shí)間--僅幾個(gè)小時(shí)的事情。 我所見(jiàn)過(guò)的混合PCR,也僅是多至3對(duì)引物而已! 如果引物太多,一是整個(gè)PCR微環(huán)境變得復(fù)雜,可能達(dá)不到單個(gè)引物擴(kuò)增時(shí)的效果,二是那么多的條帶,看得人眼花繚亂也不好判斷。這樣算來(lái),對(duì)于雜交水稻至少取200粒種子,每粒種子提取DNA后都要分別用12個(gè)PCR管,每個(gè)PCR管加一對(duì)引物,一共2400個(gè)PCR管,2400對(duì)引物,每個(gè)PCR管還要標(biāo)明是哪一粒種子,如果有兩個(gè)位點(diǎn)不同就是雜株。如果是200粒種子,確實(shí)要2400個(gè)PCR管,但不是2400對(duì)引物,還是12對(duì)引物: 第一對(duì)引物:擴(kuò)200個(gè) 第二對(duì)引物:擴(kuò)200個(gè)……第十二對(duì)引物:200個(gè)
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