一、固體培養(yǎng)基分離
1、稀釋倒平板
特點：菌落分離較為均勻,進(jìn)行微生物計數(shù)結(jié)果相對準(zhǔn)確.但操作相對麻煩,熱敏感菌有時易被燙死,而嚴(yán)格好氧菌也可能因被固定在培養(yǎng)基中生長受到影響.
2、涂布平板法
特點：操作相對簡單,是較常使用的常規(guī)方法.但有時會因涂布不均勻使某些部位的菌落不能分開,進(jìn)行微生物計數(shù)時需對稀釋和涂布過程的操作特別注意,否則不易得到準(zhǔn)確的結(jié)果.
3、平板劃線法
特點：操作簡單,多用于對已有純培養(yǎng)的確認(rèn)和再次分離.
應(yīng)用：這三種方法可用于所有能在固體培養(yǎng)基表面形成菌落的微生物的純培養(yǎng)分離.并且,通過選用適當(dāng)?shù)倪x擇平板及培養(yǎng)條件,可直接分離各種具有特定生理特征的微生物.和厭氧罐或厭氧手套箱技術(shù)結(jié)合,這3種方法也可用于獲得各種厭氧菌的純培養(yǎng).
4、稀釋搖管法
特點：稀釋倒平板法的一種變通形式,但由于菌落形成在瓊脂柱的中間,觀察和挑取都相對困難.
應(yīng)用：在缺乏專業(yè)的厭氧操作設(shè)備的情況下對嚴(yán)格厭氧菌進(jìn)行分離和觀察.
二、液體培養(yǎng)基分離
1、稀釋法
特點：工作量大,是否獲得純培養(yǎng)需依靠統(tǒng)計學(xué)的推測.
應(yīng)用：不能或不易在固體培養(yǎng)基上生長的微生物進(jìn)行純培養(yǎng)分離或數(shù)量統(tǒng)計.
2、富集培養(yǎng)
特點：一般不能直接獲得微生物的純培養(yǎng),在通過富集培養(yǎng)使原本在自然環(huán)境中占少數(shù)的微生物的數(shù)量大大提高后,需再通過平板法進(jìn)行相應(yīng)微生物純培養(yǎng)的分離和檢測.
應(yīng)用：
（1）根據(jù)某種微生物的特殊生長要求,按照意愿從自然界中對這種微生物進(jìn)行有針對性的有效分離；
（2）分離培養(yǎng)出由科學(xué)家設(shè)計的特定環(huán)境中能生長的微生物,盡管我們并不知道什么微生物能在這種特定的環(huán)境中生長.
三、顯微操作
單細(xì)胞（孢子）挑取
特點：分離過程直觀,可靠,但對儀器和操作技術(shù)要求較高,多限于高度專業(yè)化的科學(xué)研究.而挑取的微生物單細(xì)胞或孢子需經(jīng)固體或液體培養(yǎng)基培養(yǎng)后才能獲得其純培養(yǎng)物.
應(yīng)用：從樣品中直接分離所需的微生物細(xì)胞或孢子,獲得其純培養(yǎng).