在1991至1993年的實驗中,由于研究人員發(fā)現(xiàn)：生物圈2號的氧氣與二氧化碳的大氣組成比例,無法自行達到平衡；生物圈2號內的水泥建筑物影響到正常的碳循環(huán)；多數(shù)動植物無法正常生長或生殖,其滅絕的速度比預期的還要快.經廣泛討論,確認“生物圈2號”實驗失敗,未達到原先設計者的預定目標.
氧氣未能順利循環(huán)是導致生物圈二號失敗的重要原因.由于細菌在分解土壤中大量有機質的過程中,耗費了大量的氧氣；而細菌所釋放出的二氧化碳經過化學作用,被生物圈二號的混凝土墻所吸收,又打破了循環(huán),致使氧氣含量下降,不足以維持研究者的生命.此外生物圈二號中降雨失控、多數(shù)動物滅絕、為植物傳播花粉的昆蟲全部死亡等也是生物圈二號失敗的原因.