A、由題意可知，讓基因型為aaX^BX^B與AAX^bY雜交，則F₁為AaX^BX^b（紅眼正常翅雌性）、AaX^BY（紅眼正常翅雄性），A正確；
B、讓F₁AaX^BX^b（紅眼正常翅雌性）與AaX^BY（紅眼正常翅雄性）相互交配，則F₂代雄果蠅的紅眼基因來自F₁代的母方，B錯誤；
C、讓F₁AaX^BX^b（紅眼正常翅雌性）與AaX^BY（紅眼正常翅雄性）相互交配，則F₂代雄果蠅中純合子的比例

1

2

，雜合子的比

1

2

，所以F₂代雄果蠅中純合子與雜合子的比例是1：1，C正確；
D、讓F₁AaX^BX^b（紅眼正常翅雌性）與AaX^BY（紅眼正常翅雄性）相互交配，則F₂代雌果蠅正常翅個體：短翅個體=3：1，D錯誤．
故選：AC．