現(xiàn)代定義：微生物是一切肉眼看不見或看不清的微小生物 形體微小,結(jié)構(gòu)簡單,通常要用光學(xué)顯微鏡和電子顯微鏡才能看清楚的生物,統(tǒng)稱為微生物.（但有些微生物是可以看見的,像屬于真菌的蘑菇、靈芝等.）分類
原核類:三菌,三體.三菌：細菌、藍細菌、放線菌 三體：支原體、衣原體、立克次氏體 真核類:真菌,原生動物,顯微藻類.非細胞類:病毒,亞病毒 ( 類病毒,擬病毒,朊病毒).
在中國大陸地區(qū)的教科書中,均將微生物劃分為以下8大類：
　　細菌、病毒、真菌、放線菌、立克次體、支原體、衣原體、螺旋體.
　　西方與日本的教科書與上面大同小異.
　　另外廣義的微生物還會將原生動物門中的一些及其一些微浮游動物和微藻（也就是單細胞植物）包括進來.