動(dòng)物遺體都是些有機(jī)物,即含碳化合物.
微生物將其分解為CO2和水,尿素等,具體如下：
淀粉的分解和糖代謝
淀粉水淀粉在微生物分泌的胞外水解酶作用下進(jìn)行水解,微生物產(chǎn)生的淀粉酶有α-淀粉酶、β-淀粉酶、支鏈淀粉酶和葡萄糖淀粉酶,經(jīng)多種水解酶作用下生成葡萄糖.淀粉→糊精→麥芽糖→葡萄糖
糖代謝：葡萄糖→糖酵解產(chǎn)生丙酮酸.
有氧下：丙酮酸→TCA循環(huán) →CO2、H2O
無(wú)氧下：丙酮酸→乳酸、丁酸、乙醇等,如繼續(xù)無(wú)氧環(huán)境進(jìn)行甲烷發(fā)酵.
但乳酸、丁酸、乙醇等如在有氧環(huán)境下則進(jìn)入TCA循環(huán),生成CO2、H2O等.
纖維素分解和代謝
纖維素→纖維二糖 →葡萄糖 →糖代謝產(chǎn)物
纖維素和淀粉的共同點(diǎn)都是葡萄糖為單體組成單位,但它們的差異是葡萄糖單體間的連接鍵方式不同.淀粉可被較多微生物水解利用,而利用纖維素的微生物則較有限.一些細(xì)菌、放線菌、真菌（如青霉、曲霉、鐮刀霉、木霉等）可生成纖維素酶,將纖維素水解成葡萄糖,后葡萄糖與淀粉一樣進(jìn)入糖代謝循環(huán),產(chǎn)生有氧無(wú)氧下的不同產(chǎn)物.
油脂的分解與轉(zhuǎn)化
脂肪由甘油與脂肪酸組成.有些細(xì)菌、霉菌等水解脂肪生成甘油與脂肪酸,并進(jìn)行代謝.
甘油：有氧下甘油→丙酮→氧化成乙酰輔酶→TCA循環(huán)代謝產(chǎn)物
無(wú)氧下代謝產(chǎn)生簡(jiǎn)單的酸、酮等中間物.
脂肪酸在有氧下進(jìn)行β-氧化,生成乙酸,后轉(zhuǎn)化成乙酰輔酶A進(jìn)入TCA循環(huán),生出CO2、H2O產(chǎn)物；無(wú)氧下分解成簡(jiǎn)單的酸、CO2、CH4等物質(zhì).
芳香族化合物（帶苯環(huán)衍生物）轉(zhuǎn)化
苯環(huán)物質(zhì)：如酚類物質(zhì),首先被能利用酚類物質(zhì)的微生物打開(kāi)苯環(huán),使形成鏈狀的含碳物質(zhì),后在有氧下進(jìn)行含碳物質(zhì)的有氧代謝和無(wú)氧下含碳物質(zhì)的無(wú)氧代謝.
烴類化合物：不飽和烴類物質(zhì)如稀烴、炔烴被利用烴物質(zhì)的微生物打開(kāi)不抱和鍵,生成烷烴.烷烴在有氧下氧化成脂肪酸,后進(jìn)入脂肪酸的有氧代謝途徑和無(wú)氧代謝途徑.