同種生物同一性狀的不同表現(xiàn)形式叫做相對性狀，牛的毛色的黑色和棕色就是一對相對性狀；在一對相對性狀的遺傳過程中，子代個體出現(xiàn)了親代沒有的性狀，則親代個體表現(xiàn)的性狀是顯性性狀，子代新出現(xiàn)的性狀一定是隱性性狀，由一對隱性基因控制；因此如果兩頭黑牛交配，產(chǎn)下了一頭棕色子牛，則黑色和棕色這對相對性狀中，黑色是顯性性狀，棕色是隱性性狀．
（1）若用B和b表示牛的毛色的顯性基因和隱性基因，兩頭黑牛交配產(chǎn)下了一頭棕色子牛，則棕色牛的基因組成是bb，這對基因由兩頭黑牛各提供一個，即親代黑牛的基因組成是Bb．如圖1所示：
（2）由遺傳圖解可知：上述兩頭黑牛產(chǎn)下一黑色子牛的可能性是75%即3/4，該黑色子牛的基因型為BB的可能性是25%即1/4．
在親代的生殖細胞形成過程中，經(jīng)過減數(shù)分裂，兩條性染色體彼此分離，雄性產(chǎn)生兩種類型的精子--含X染色體的精子和含Y染色體的精子．雌性則只產(chǎn)一種含X染色體的卵細胞．受精時，如果是含X的精子與卵子結(jié)合，就產(chǎn)生具有XX的受精卵并發(fā)育成雌性；如果是含Y的精子與卵子結(jié)合，就產(chǎn)生具有XY的受精卵并發(fā)育成為雄性．由于雄性可產(chǎn)生數(shù)量相等的X精子與Y精子，加之它們與卵子結(jié)合的機會相等，所以每次生雌性與雄性的概率是相等的，性別之比大致1：1．因此生一只雌性小牛的可能性是1/2，故上述兩頭黑牛再產(chǎn)生一只雌性黑色小牛的可能性是1/2×3/4═3/8．
（3）某良種場現(xiàn)有兩欄牛，甲欄全為黑色，乙欄既有黑色，又有棕色．甲、乙兩欄牛是親子代關(guān)系．①若乙欄牛為甲欄牛的后代，即兩頭黑牛交配，產(chǎn)下了棕色子牛和黑色子牛，因此黑色是顯性，棕色是隱性，則甲欄牛（是親代）中某些個體的基因組成肯定是Bb，乙欄牛（是子代）的基因組成為BB、Bb、bb，遺傳圖解如圖1所示；②若甲欄牛為乙欄牛的后代，即棕色牛和黑色牛交配后代全是黑色的子牛，因此黑色是顯性，棕色是隱性，則甲欄牛（是子代）的基因組成為Bb，乙欄牛（是親代）的基因組成為BB和bb．遺傳圖解如圖2所示．
（4）細胞核是遺傳信息庫，染色體位于細胞核中，某農(nóng)科院利用棕色公牛的體細胞的細胞核和黑色母牛的去核卵細胞，組成重組細胞，經(jīng)過多次分裂后，植入另一頭黑色母牛的子宮孕育，則所生牛犢的遺傳物質(zhì)全部來自于棕色公牛的體細胞的細胞核，因此所生牛犢的性染色體組成應(yīng)該是XY，體色是棕色．
（5）已知牛角的基因組成與性狀表現(xiàn)的關(guān)系如下表所示，現(xiàn)有一頭有角母牛生了一頭無角小牛，從表格中可知有角母牛的基因組成是HH，如果這頭小牛的性別為雄性其基因組成應(yīng)該是hh，h一定來源于有角母牛（HH），顯然不可能；若這頭小牛的性別為雌性，基因組成可能是Hh或hh，基因組成為hh的不可能，因為有角母牛HH不能提供h；若無角小牛的基因組成是Hh，H來源于有角母牛，h來源于有角公牛（Hh），符合題意．故無角小牛的性別是雌性，基因組成是Hh．    
故答案為：
（1）Bb；Bb；   
（2）3/8；   
（3）①Bb；BB、Bb、bb；
②Bb；BB和bb；
（4）XY；棕色；  
（5）雌性；Hh．