A、由題干已知紅眼雌果蠅與白眼雄果蠅交配，子代雌雄果蠅都表現(xiàn)紅眼，所以紅眼為顯性性狀，白眼為隱性性狀，A正確；
B、由題意分析，親本紅眼和白眼雜交，子代全是紅眼，子二代出現(xiàn)了紅眼和白眼，符合孟德爾一對(duì)相對(duì)性狀的遺傳實(shí)驗(yàn)，所以眼色遺傳符合分離規(guī)律，B正確；
C、由題意分析可知控制眼色的基因在X染色體上，表現(xiàn)為伴性遺傳，C錯(cuò)誤；
D、子代雌雄果蠅交配產(chǎn)生的后代中，紅眼雄果蠅占

1

4

，白眼雄果蠅占

1

4

，紅眼雌果蠅占

1

2

，即紅眼有雄果蠅也有雌果蠅，白眼全部是雄果蠅，故可判斷紅眼和白眼基因位于X染色體上，D正確．
故選：C．