PCR-DGGE檢測厭氧反應(yīng)器中的微生物,為何測序回來的結(jié)果大都是所謂的宏基因組呢?與預(yù)期的一點邊都不沾啊
PCR-DGGE檢測厭氧反應(yīng)器中的微生物,為何測序回來的結(jié)果大都是所謂的宏基因組呢?與預(yù)期的一點邊都不沾啊
“Metagenome sequence ctg1167,whole genome shotgun sequence” 宏基因組序列ctg1167,全基因組鳥槍序列“Marine metagenome ”海洋宏基因組“Compost metagenome contig”宏基因組堆肥重疊群"Human gut metagenome DNA"人類腸道宏基因組DNA------這些跟我的反應(yīng)器中的微生物幾乎沒有關(guān)系啊,正常應(yīng)該是厭氧氨氧化菌、產(chǎn)甲烷菌、變形菌等等的啊,郁悶啊,是我做的有問題,還是測序有問題,還是反應(yīng)器就這樣,還是別的,要交畢業(yè)論文了,這些還沒弄明白,著急,
“Metagenome sequence ctg1167,whole genome shotgun sequence” 宏基因組序列ctg1167,全基因組鳥槍序列“Marine metagenome ”海洋宏基因組“Compost metagenome contig”宏基因組堆肥重疊群"Human gut metagenome DNA"人類腸道宏基因組DNA------這些跟我的反應(yīng)器中的微生物幾乎沒有關(guān)系啊,正常應(yīng)該是厭氧氨氧化菌、產(chǎn)甲烷菌、變形菌等等的啊,郁悶啊,是我做的有問題,還是測序有問題,還是反應(yīng)器就這樣,還是別的,要交畢業(yè)論文了,這些還沒弄明白,著急,
語文人氣：483 ℃時間：2020-08-13 15:46:14
優(yōu)質(zhì)解答
話說我也在說畢設(shè).lz你做的是厭氧反應(yīng)器中的微生物,那么你測的是16s V3區(qū)的pcr 還是整個16s的pcr.PCR-DGGE之后你是直接割膠純化測序,還是連質(zhì)粒轉(zhuǎn)化然后測序的啊.求你做的順序,我要作參考.16s V3區(qū)，引物338-518和333-533，自己連接轉(zhuǎn)化，后送交測序公司測序，謝謝！??！那么你當(dāng)時做PCR的條帶好不好，連接之后又做過PCR進行驗證么？怎么感覺測的是大腸桿菌的基因啊.話說，我問過師兄了，你得說下自己的流程。他覺得你可能流程出現(xiàn)問題了，你都說下，然后看看那里出現(xiàn)錯誤了。 最重要的是你挑單克隆了么？
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