核酸內(nèi)切酶 endonuclease
核酸內(nèi)切酶是在核酸水解酶中,水解DNA分子鏈內(nèi)部磷酸二酯鍵生成寡/寡聚核苷酸的酶.從對(duì)底物的特異性來看,可分為DNaseⅠ、DNaseⅡ等僅分解DNA的酶；脾臟RNase、RNaseT1等僅分解RNA的酶；還有就是如鏈孢霉（Neurospora）核酸酶這類既分解DNA又分解RNA的酶.一般來說,大都不具堿基特異性,但也有諸如HindⅢ、EcoRⅠ等具有限制性的,能夠識(shí)別并切斷特定的堿基或堿基序列的酶.
核酸外切酶exonuclease
核酸外切酶是一類能從多核苷酸鏈的一端開始按序催化水解3、5-磷酸二酯鍵,降解核苷酸的酶.其水解的最終產(chǎn)物是單個(gè)的核苷酸（DNA為dNTP,RNA為NTP）.按作用的特性差異可以將其分為單鏈的核酸外切酶和雙鏈的核酸外切酶.
單鏈的核酸外切酶包括大腸桿菌核酸外切酶Ⅰ（exoⅠ）和核酸外切酶Ⅶ（exoⅦ）.核酸外切酶Ⅶ（exoⅦ）能夠從5′-末端或3′-末端呈單鏈狀態(tài)的DNA分子上降解DNA,產(chǎn)生出寡核苷酸短片段,而且是唯一不需要Mg2+離子的活性酶,是一種耐受性很強(qiáng)的核酸酶.核酸外切酶Ⅶ（exoⅦ）可以用來測定基因組DNA中一些特殊的間隔序列和編碼序列的位置.它只切割末端有單鏈突出的DNA分子.
雙鏈的核酸外切酶包括大腸桿菌核酸外切酶Ⅲ（exoⅢ）、λ噬菌體核酸外切酶（λexo）以及T7噬菌體基因6核酸外切酶等.大腸桿菌核酸外切酶Ⅲ（exo Ⅲ）具有多種催化功能,可以降解雙鏈DNA分子中的許多類型的磷酸二酯鍵.其中主要的催化活性是催化雙鏈DNA按3′→5′的方向從3′-OH末端釋放5′-單核苷酸.大腸桿菌核酸外切酶Ⅲ（exoⅢ）通過其3′→5′外切酶活性使雙鏈DNA分子產(chǎn)生出單鏈區(qū),經(jīng)過這種修飾的DNA再配合使用Klenow酶,同時(shí)加進(jìn)帶放射性同位素的核苷酸,便可以制備特異性的放射性探針.
λ噬菌體核酸外切酶（λexo）最初是從感染了λ噬菌體的大腸桿菌細(xì)胞中純化出來的.這種酶催化雙鏈DNA分子從5′-P末端進(jìn)行逐步的水解釋放出5′-單核苷酸.但不能降解5′-OH末端.