目前生物分類以1969年魏泰克發(fā)表的“五界說”最為普遍,分別原核生物界、原生生物界、植物界、動(dòng)物界、真菌界.然而由于五界說并沒有納入病毒、噬菌體、類病毒等,因此卡爾·沃斯等人于1990年發(fā)表了“三域系統(tǒng)”,將上述生物納入其中,分為細(xì)菌域、古菌域、真核域.
原核生物界（Prokaryotae）：三域系統(tǒng)中的古菌域與細(xì)菌域同歸于原核生物界.五界說的原核生物界則是包括沒有核膜的細(xì)菌等.
古菌域（Archaea）：一般生存于極端環(huán)境,如深海、鹽湖、火山口等.包括嗜鹽菌、一些超嗜熱菌、嗜酸菌等.參見古菌分類表.
細(xì)菌域（Bacteria）：包括藍(lán)綠菌（原名藍(lán)綠藻）、放線菌、衣原體、支原體、立克次體等.參見細(xì)菌分類表.
真核域（Eukarya）
原生生物界（Protista或Protoctista）：五界說中最備受爭(zhēng)議、也最為復(fù)雜的一群.主因是其他四界皆有明確之規(guī)定,而剩余的都被歸于這一類,因此2000年、2006年的新分類法將原生生物界再細(xì)分成三界,但一般國高中教科書仍以五界說作為主要討論內(nèi)容,只有專家學(xué)者才會(huì)深入研究.原生生物多半為單細(xì)胞及單細(xì)胞復(fù)合體（即介于單細(xì)胞與常見的多細(xì)胞生物,能以單細(xì)胞或多細(xì)胞的形式存活,可能在不同階段、或因環(huán)境惡劣而改變形式.多細(xì)胞生物的定義是聚集、細(xì)胞間有分工以及訊息傳遞）.
真菌界（Fungi）：包括接合菌、子囊菌、擔(dān)子菌、壺菌、聚合菌和微孢子蟲.所謂聚合菌一般稱為黏菌slime(即史萊姆).但事實(shí)上在五界說中,黏菌、壺菌會(huì)被歸在原生生物界中,而且彼此關(guān)系甚遠(yuǎn).但是在提到真菌fungi一詞時(shí),仍然會(huì)將之一起比較.參見真菌分類表.
植物界（Plantae）：包含綠藻、輪藻、苔蘚植物、蕨類植物、種子植物等.在五界說中,除了極少數(shù)在分類上有爭(zhēng)議的綠藻部份為單細(xì)胞（爭(zhēng)議點(diǎn)為歸屬于Protista）,否則原則上植物界皆為多細(xì)胞.參見植物分類表 (NCBI).