種類：根據(jù)蛋白分離的難易及在膜中分布的位置,膜蛋白基本可分為三大類：外在膜蛋白或稱外周膜蛋白、內(nèi)在膜蛋白或稱整合膜蛋白和脂錨定蛋白.
結(jié)構(gòu)：外在膜蛋白分布在膜的內(nèi)外表面,約占膜蛋白的20%～30%,主要在內(nèi)表面,為水溶性蛋白,它通過離子鍵、氫鍵與膜脂分子的極性頭部相結(jié)合,或通過與內(nèi)在蛋白的相互作用,間接與膜結(jié)合.內(nèi)在蛋白約占膜蛋白的70%～80%,是雙親媒性分子,可不同程度的嵌入脂雙層分子中.有的貫穿整個脂雙層,兩端暴露于膜的內(nèi)外表面,這種類型的膜蛋白又稱跨膜蛋白.內(nèi)在膜蛋白露出膜外的部分含較多的極性氨基酸,屬親水性,與磷脂分子的親水頭部鄰近；嵌入脂雙層內(nèi)部的膜蛋白由一些非極性的氨基酸組成,與脂質(zhì)分子的疏水尾部相互結(jié)合,因此與膜結(jié)合非常緊密.　脂錨定膜蛋白是通過與之共價相連的脂分子插入膜的脂雙分子中,從而錨定在細(xì)胞質(zhì)膜上
功能：膜蛋白的功能是多方面的.有些膜蛋白可作為“載體”而將物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)進(jìn)出細(xì)胞.有些膜蛋白是激素或其他化學(xué)物質(zhì)的專一受體,如甲狀腺細(xì)胞上有接受來自腦垂體的促甲狀腺素的受體.膜表面還有各種酶,使專一的化學(xué)反應(yīng)能在膜上進(jìn)行,如內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上的能催化磷脂的合成等.細(xì)胞的識別功能也決定于膜表面的蛋白質(zhì).這些蛋白常常是表面抗原.表面抗原能和特異的抗體結(jié)合,如人細(xì)胞表面有一種蛋白質(zhì)抗原HLA,是一種變化極多的二聚體.不同的人有不同的HLA分子,器官移植時,被植入的器官常常被排斥,這就是因?yàn)橹踩爰?xì)胞的HLA分子不為受體所接受之故.