tRNA呈三葉草結(jié)構(gòu).它由3個環(huán),即D環(huán)〔因該處二氫尿苷酸（D）含量高〕、反密碼環(huán)（該環(huán)中部為反密碼子）和TΨC環(huán)〔因絕大多數(shù)tRNA在該處含胸苷酸（T）、假尿苷酸（Ψ）、胞苷酸（C）順序〕,四個莖,即D莖（與D環(huán)聯(lián)接的莖）、反密碼莖（與反密碼環(huán)聯(lián)接）、TΨC莖（與 TΨC環(huán)聯(lián)接）和氨基酸接受莖〔也叫CCA莖,因所有tRNA的分子末端均含胞苷酸（C）、胞苷酸（C）、腺苷酸（A）順序,CCA是連接氨基酸所不可缺少的〕,以及位于反密碼莖與TΨC莖之間的可變臂構(gòu)成.
rRNA（核糖體RNA）：原核生物和真核生物的核糖體均由大、小兩種亞基組成.rRNA是單鏈,它包含不等量的A與U、G與C,但是有廣泛的雙鏈區(qū)域.在雙鏈區(qū),堿基因氫鍵相連,表現(xiàn)為發(fā)夾式螺旋.
mRNA：從DNA轉(zhuǎn)錄合成的帶有遺傳信息的一類單鏈RNA,它在上作為蛋白質(zhì)合成的模板,決定肽鏈的排列順序.原核生物mRNA一般5'端有一段不翻譯區(qū),稱前導(dǎo)順序,3'端有一段不翻譯區(qū),中間是蛋白質(zhì)的編碼區(qū),一般編碼幾種蛋白質(zhì).通常mRNA（單鏈）分子自身回折產(chǎn)生許多雙鏈結(jié)構(gòu).
相同：都是由核糖,尿嘧啶,胞嘧啶,鳥嘌呤,腺嘌呤和磷酸組成.