原子論者將自然世界理論化為由兩基本部分所構(gòu)成:不可分割的原子和空無的虛空(void).在化學(xué)反應(yīng)后,原子仍保持自身不變.分子學(xué)說認為：(1)物質(zhì)是由分子組成的,分子是保留原物質(zhì)性質(zhì)的微粒.例如,糖溶解在一杯水里,糖分子遍及全杯水,水就有了甜味.(2)分子是由原子組成,原子則是用化學(xué)方法不能再分割的最小粒子,它已失去了原物質(zhì)的性質(zhì).例如,我們平時食用的食鹽(氯化鈉)的分子是由鈉原子和氯原子組成的,氯是有毒的,顯然食鹽的性質(zhì)與氯和鈉的性質(zhì)截然不同；另一方面,完全無害的元素碳和氮,組成的化合物卻可以是劇毒的氣體氰(CN)化物.