一個(gè)很大的缺陷就是硅同氧的結(jié)合力非常強(qiáng).當(dāng)碳在地球生物的呼吸過程中被氧化時(shí),會(huì)形成二氧化碳?xì)怏w,這是種很容易從生物體中移除的廢棄物質(zhì)；但是,硅的氧化會(huì)形成固體,因?yàn)樵诙趸鑴傂纬傻臅r(shí)候就會(huì)形成晶格,使得每個(gè)硅原子都被四個(gè)氧原子包圍,而不是象二氧化碳那樣每個(gè)分子都是單獨(dú)游離的,處置這樣的固體物質(zhì)會(huì)給硅基生命的呼吸過程帶來很大挑戰(zhàn).
只要是生命形態(tài),就必須從外界環(huán)境中收集、儲(chǔ)存和利用能量.在碳基生物這里,儲(chǔ)存能量的最基本的化合物是碳水化合物.在碳水化合物中,碳原子由單鍵連接成一條鏈,而利用酶控制的對(duì)碳水化合物的一系列氧化步驟會(huì)釋放能量,廢棄物產(chǎn)生水和二氧化碳.這些酶是些大而復(fù)雜的分子,它們依照分子的形狀和左旋右旋對(duì)特定的反應(yīng)進(jìn)行催化,這里說的左旋右旋是因分子含有的碳的不對(duì)稱使得分子出現(xiàn)左旋或者右旋,而多數(shù)碳基生物體內(nèi)的物質(zhì)都顯示這個(gè)特征,正是這個(gè)特點(diǎn)使得酶能夠識(shí)別和規(guī)范碳基生物體內(nèi)的大量不同新陳代謝進(jìn)程.然而,硅沒能象碳這樣產(chǎn)生眾多的具有左旋右旋特征的化合物,這也讓它難以成為生命所需要大量相互聯(lián)系的鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的支持元素.
此外,硅鏈在水中不穩(wěn)定,容易斷掉,不象碳鏈這樣在干濕環(huán)境下都保持穩(wěn)定.雖然這點(diǎn)不會(huì)因此排除硅基生命存在的可能,但存在大量液態(tài)水的星球肯定是排斥硅基生命的.