將待分析的序列裝入Channel,點擊要分析的Channel,然后通過Restriction/Analysis 命令打開對話框.
參數(shù)說明如下：
Results 分析結(jié)果顯示
其中包括：
Show summary（顯示概要） Show sites on sequence（在結(jié)果中顯示酶切位點）
Draw restriction map（顯示限制性酶切圖）Draw restriction pattern（顯示限制性酶切模式圖）
Ignore enzymes with more than（忽略大于某設(shè)定值的酶切位點）
Ignore enzymes with less than（忽略小于某設(shè)定值的酶切位點）
Target DNA （目標(biāo)DNA 特性）
circular（環(huán)型DNA）,dam/dcm methylation（dam/dcm 甲基化）
參數(shù)說明如下：
Enzyme
代表（enzyme data file）,點擊旁邊的下拉按鈕,出現(xiàn)兩個默認(rèn)選項,restrict.enz 和dnamane.enz,
如果添加過自制的酶列表,則附加顯示自制酶列表文件名.其中restrict.enz 數(shù)據(jù)文件包含180 種
限制酶,dnamane.enz 數(shù)據(jù)文件包含2524 種限制酶.選擇其中一個數(shù)據(jù)文件,相應(yīng)的酶在左邊的 顯示框中列出（按酶名稱字母表順序）,鼠標(biāo)雙擊酶名稱,則對應(yīng)的酶被選中,在右邊空白框中列 出.要自制酶切列表,可以從左邊酶列表中雙擊鼠標(biāo)選擇多種酶（例如puc18 multiple cloning sites）,然后點擊按鈕出現(xiàn)下列對話框：輸入要保存酶列表的文件名,點擊按鈕即可保存.自制酶列表可以方便分析特定的酶切位點.
Cutter 酶切識別序列長度；End 酶切產(chǎn)生的末端,其中包括,Blunt（平頭末端）,5’Overhang
（5’突出粘性末端）,3’Overhang(3’突出粘性末端),系統(tǒng)根據(jù)cutter 和end 的設(shè)定情況,在左邊酶列表 中顯示符合條件的酶.最后,點擊按鈕執(zhí)行操作.