A、實(shí)現(xiàn)物質(zhì)循環(huán)至少具備生產(chǎn)者和分解者，由題干信息可知，泥漿生物反應(yīng)器中，只加入了分解者，因此不能實(shí)現(xiàn)物質(zhì)循環(huán)，A錯(cuò)誤；
B、由題干信息可知，菌種進(jìn)行有氧呼吸分解污染物，因此污染物應(yīng)是有機(jī)物，B正確；
C、生態(tài)系統(tǒng)的組成有非生物的物質(zhì)和能量、生產(chǎn)者、消費(fèi)者、分解者組成，由題意可知，泥漿生物反應(yīng)器中只有非生物的物質(zhì)和能量、分解者，不能構(gòu)成生態(tài)系統(tǒng)，C錯(cuò)誤；
D、泥漿生物反應(yīng)器中的有機(jī)物中的能量是能量的輸入，菌種利用有機(jī)物中的能量進(jìn)行繁殖和呼吸，屬于能量的轉(zhuǎn)換和散失，該過程沒有能量的傳遞過程，D錯(cuò)誤．
故選：B．