區(qū)域化,即細胞的各種生物分子通常都限制在一定的區(qū)域內,如DNA只是存在于細胞核內,核糖體則留在細胞質內；不同的區(qū)域負責不同的功能,如細胞的能量代謝主要發(fā)生在線粒體內,蛋白質翻譯則在細胞質內進行.此外,生物體常常通過生物分子在不同區(qū)域的移動來控制和實施其生命活動.例如,細胞色素C是存在于線粒體內的一種蛋白質.當細胞受到傷害時,細胞可以通過一系列調節(jié)細胞死亡的信號蛋白的相互作用,將細胞色素C釋放到細胞質,從而啟動執(zhí)行細胞死亡的蛋白機器,最后導致細胞死亡.顯然,生物網絡的這種對時空的依賴性更導致了生物系統(tǒng)行為的復雜化.