根據(jù)微生物的進化水平和各種性狀上的明顯差別,可分為
1.原核生物：粗分包括,細菌（狹義的）、放線菌、藍細菌、支原體、立克次氏體和衣原體.
2.真核生物：主要包括菌物界中的真菌、粘菌、假菌,植物界中的顯微藻類和動物界中的原生動物.真菌主要包括酵母,霉菌,蕈菌（蘑菇一類）.
3.非細胞微生物：包括真病毒和亞病毒,亞病毒含有類病毒,擬病毒,朊病毒.
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