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  • primer5.0引物設(shè)計所用序列為什么是mRNA?

    primer5.0引物設(shè)計所用序列為什么是mRNA?
    做qRT-PCR時設(shè)計引物是直接將NCBI的mRNA區(qū)域中CDS區(qū)序列拷貝到primer5.0里面,可是做qRT-PCR前不是有一步是將RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA嗎?那以mRNA設(shè)計引物不是反了嗎?我覺得是應(yīng)該以mRNA的互補序列設(shè)計引物才對啊?
    生物人氣:671 ℃時間:2020-02-04 07:11:56
    優(yōu)質(zhì)解答
    設(shè)計引物的時候已經(jīng)用到了兩條鏈吧,一條鏈設(shè)計前引物,另一條設(shè)計后引物.RT-PCR得到的是雙鏈cDNA,所以用mRNA設(shè)計或者用互補鏈設(shè)計都可以啊,因為著兩條鏈都會用到,只要把U換成T,是絕對可以P出來的.逆轉(zhuǎn)錄分三步,第一步是以mRNA為模板形成一條單鏈cDNA,第二步是水解mRNA,第三步是以單鏈cDNA為模板形成雙鏈cDNA。大多數(shù)反轉(zhuǎn)錄酶都具有多種酶活性,主要包括以下幾種活性。①DNA聚合酶活性;以RNA為模板,催化dNTP聚合成DNA的過程。此酶需要RNA為引物,多為賴氨酸的tRNA,在引物tRNA 3'-末端以5'→3'方向合成DNA。反轉(zhuǎn)錄酶中不具有3'→5'外切酶活性,因此沒有校正功能,所以由反轉(zhuǎn)錄酶催化合成的DNA出錯率比較高。②RNase H活性;由反轉(zhuǎn)錄酶催化合成的cDNA與模板RNA形成的雜交分子,將由RNase H從RNA 5'端水解掉RNA分子。③DNA指導的DNA聚合酶活性;以反轉(zhuǎn)錄合成的第一條DNA單鏈為模板,以dNTP為底物,再合成第二條DNA分子
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