目前,大家公認(rèn)的生物多樣性的三個(gè)主要層次是物種多樣性、基因多樣性(或稱(chēng)遺傳多樣性)和生態(tài)系統(tǒng)多樣性.這是組建生物多樣性的三個(gè)基本層次.物種多樣性常用物種豐富度來(lái)表示.所謂物種豐富度是指一定面積內(nèi)種的總數(shù)目.到目前為止,已被描述和命名的生物種有200萬(wàn)種左右,但科學(xué)家對(duì)地球上實(shí)際存在的生物種的總數(shù)估計(jì)出入很大,由500萬(wàn)到1億種.其中以昆蟲(chóng)和微生物所占的比例最大.基因多樣性代表生物種群之內(nèi)和種群之間的遺傳結(jié)構(gòu)的變異.每一個(gè)物種包括由若干個(gè)體組成的若干種群.各個(gè)種群由于突變、自然選擇或其他原因,往往在遺傳上不同.因此,某些種群具有在另一些種群中沒(méi)有的基因突變(等位基因),或者在一個(gè)種群中很稀少的等位基因可能在另一個(gè)種群中出現(xiàn)很多.這些遺傳差別使得有機(jī)體能在局部環(huán)境中的特定條件下更加成功地繁殖和適應(yīng).不僅同一個(gè)種的不同種群遺傳特征有所不同,即存在種群之間的基因多樣性；在同一個(gè)種群之內(nèi)也有基因多樣性──在一個(gè)種群中某些個(gè)體常常具有基因突變.這種種群之內(nèi)的基因多樣性就是進(jìn)化材料.具有較高基因多樣性的種群,可能有某些個(gè)體能忍受環(huán)境的不利改變,并把它們的基因傳遞給后代.環(huán)境的加速改變,使得基因多樣性的保護(hù)在生物多樣性保護(hù)中占據(jù)著十分重要的地位.基因多樣性提供了栽培植物和家養(yǎng)動(dòng)物的育種材料,使人們能夠選育具有符合人們要求的性狀的個(gè)體和種群.生態(tài)系統(tǒng)多樣性既存在于生態(tài)系統(tǒng)之間,也存在于一個(gè)生態(tài)系統(tǒng)之內(nèi).在前一種情況下,在各地區(qū)不同背景中形成多樣的生境,分布著不同的生態(tài)系統(tǒng)；在后一種情況下,一個(gè)生態(tài)系統(tǒng)其群落由不同的種組成,它們的結(jié)構(gòu)關(guān)系(包括垂直和水平的空間結(jié)構(gòu),營(yíng)養(yǎng)結(jié)構(gòu)中的關(guān)系,如捕食者與被捕者、草食動(dòng)物與植物、寄生物與寄主等)多樣,執(zhí)行的功能不同,因而在生態(tài)系統(tǒng)中的作用也不一樣.總之,物種多樣性是生物多樣性最直觀的體現(xiàn),是生物多樣性概念的中心；基因多樣性是生物多樣性的內(nèi)在形式,一個(gè)物種就是一個(gè)獨(dú)特的基因庫(kù),可以說(shuō)每一個(gè)物種就是基因多樣性的載體；生態(tài)系統(tǒng)的多樣性是生物多樣性的外在形式,保護(hù)生物的多樣性,最有效的形式是保護(hù)生態(tài)系統(tǒng)的多樣性.