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  • PCR擴(kuò)增1829BP的片段,一對(duì)引物的Tm都是64度,退火溫度已經(jīng)試過55和50度都沒有目的條帶,請(qǐng)教pcr設(shè)置參數(shù)

    PCR擴(kuò)增1829BP的片段,一對(duì)引物的Tm都是64度,退火溫度已經(jīng)試過55和50度都沒有目的條帶,請(qǐng)教pcr設(shè)置參數(shù)
    在55和50度只看到引物二聚體且有拖尾現(xiàn)象,沒有目的條帶
    生物人氣:364 ℃時(shí)間:2020-02-06 00:50:07
    優(yōu)質(zhì)解答
    首先,要確定引物設(shè)計(jì)成功了啊.
    其次,確定試劑都是好的.
    再次,確定模板DNA是沒有降解太厲害.
    還有就是PCR房間溫度要控制在室溫狀態(tài).
    像這種夏天要要保持在25--30度室溫.
    以上都確定了之后,我建議你設(shè)計(jì)一下touchdown程序(每個(gè)循環(huán)降0.5度,這個(gè)具體程序你去查查,既可以減少非特異擴(kuò)增,而且不用摸退火溫度條件).
    你還可以摸摸溫度梯度咯.這個(gè)程序就是那個(gè)Gradient選項(xiàng)(前提你的PCR儀是可以做溫度梯度的PCR).
    如果所有的溫度梯度都擴(kuò)增不出來(lái),我就傾向于是你的引物設(shè)計(jì)不好了.
    一般退火溫度越高,越不容易出現(xiàn)非特異,它對(duì)引物和模板的匹配要求很高.如果擴(kuò)增不出來(lái),可以考慮降低退火溫度,這樣雖然容易出現(xiàn)非特異片段,但是目的片段也相應(yīng)容易擴(kuò)增出來(lái).
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