1994年,我國HGP在吳旻、強伯勤、陳竺、楊煥明的倡導下啟動,最初由國家自然科學基金會和863高科技計劃的支持下,先后啟動了“中華民族基因組中若干位點基因結(jié)構(gòu)的研究”和“重大疾病相關(guān)基因的定位、克隆、結(jié)構(gòu)和功能研究”,1998年在國家科技部的領導和牽線下,1998年在上海成立了南方基因中心,1999年在北京成立了北方人類基因組中心,1998年,組建了中科院遺傳所.1999年7月在國際人類基因組注冊,得到完成人類3號染色體短臂上一個約30Mb區(qū)域的測序任務,該區(qū)域約占人類整個基因組的1％.