根據(jù)染色體-基因理論,基因在染色體上按一定的順序和距離呈線(xiàn)性排列,相鄰兩基因位點(diǎn)之間發(fā)生斷裂和交換而形成重組型配子的幾率與二者間的距離呈正相關(guān),即距離越大,斷裂和交換而產(chǎn)生重組型配子的幾率也越大.因此,兩基因間相對(duì)距離的大小可以用交換率來(lái)反映.規(guī)定1%的交換率稱(chēng)為一個(gè)遺傳圖距(1cM = 1Mbp),兩基因間的相對(duì)距離(遺傳距離)用兩基因的交換率來(lái)表示.交換率越小,表明兩個(gè)基因間的距離越近,連鎖越緊密；反之,交換率越大,則兩基因間距離越遠(yuǎn),連鎖越松散.連鎖分析就是要測(cè)定基因間的交換值,并確定基因間的排列順序,繪出連鎖遺傳圖(linkage map).通過(guò)連鎖分析可以確定基因在染色體上的相對(duì)位置,因此也稱(chēng)為基因定位(gene location).