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  • 關(guān)于引物設(shè)計(jì)

    關(guān)于引物設(shè)計(jì)
    要對(duì)目的基因進(jìn)行定量分析,基因全長(zhǎng)1932NT,是不是只要選擇其中的一段就行了,長(zhǎng)約400NT左右,那么這一段應(yīng)如何選?該基因的保守序列嗎?該怎么確定一段基因是否是保守序列?我在GNEBANK里也查到了該基因,但未指出保守序列!
    數(shù)學(xué)人氣:982 ℃時(shí)間:2020-04-05 01:28:20
    優(yōu)質(zhì)解答
    要定量分析是指要做Realtime PCR吧.那么引物需要滿足的是
    1.特異性片段,在基因組里特異性比較高;
    2.最好跨內(nèi)含子設(shè)計(jì)兩引物,可以避免基因組干擾;
    3.產(chǎn)物長(zhǎng)度在200bp以內(nèi)比較好
    如果只是RT-PCR,那么片段長(zhǎng)度也要小于500bp,然后選擇跨內(nèi)含子比較好.
    至于如何確定保守區(qū)特異區(qū),把基因全長(zhǎng)在blast里面比較,看在所有物種里面哪段保守性好,blast里面會(huì)用不同顏色線段表示
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