給你舉個(gè)例子,比如一個(gè)基因組大小是1M,測(cè)序得到若干條reads,這些reads進(jìn)行拼接,如果完全可以拼接起來,中間沒有g(shù)ap的序列稱為contig,即連續(xù)的意思.如果中間有g(shù)ap,但是可以知道gap的 長(zhǎng)度,這樣的序列就叫做scaffold,即腳手架（非連續(xù)）的意思.
然后把contig 和 scaffold 從長(zhǎng)到短進(jìn)行排列,然后相加,當(dāng)恰好加到1M的50％,也就是500k的時(shí)候 ,那一條contig 或者scaffold 的長(zhǎng)度就叫做Contig N50和Scaffold N50.很明顯這個(gè)數(shù)值越大說明組裝的質(zhì)量越好.
高通量測(cè)序基因組拼接技術(shù)指標(biāo)中的Contig N50和Scaffold
高通量測(cè)序基因組拼接技術(shù)指標(biāo)中的Contig N50和Scaffold
數(shù)學(xué)人氣：258 ℃時(shí)間：2020-01-29 00:22:50
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