“普通的基因測序”應(yīng)該是指“常規(guī)DNA測序”吧,是用Sanger法（也就是雙脫氧法）進行測序的方法,目前非常普遍的是直接用ABI 3730xl 進行的自動測序,基本上可以做到600bp-800bp的讀長.
高通量測序的概念其實是一個相對的概念,在2000年的時候,3700、MegaBace等儀器上的測序也是高通量測序,是相對手工測序或者跑平板膠來說的.
不過到2005年以后,高通量測序就改指第二代測序（Next generation sequencing）,454、Solexa(后改為Illumina）和SOLiD等第二代測序,比3730等第一代測序的通量提高了成千上萬倍,甚至上億倍,所以稱為高通量測序.
NGS的特點主要有：
1、通量高,一個RUN能產(chǎn)生500Mb-600Gb的數(shù)據(jù)量
2、讀長相對較短,454(約400-500bp),Illumina（100-250bp）,SOLiD（75-100）
3、單位數(shù)據(jù)的成本非常低,現(xiàn)在很多項目測序的費用,已經(jīng)非常低,生物信息分析成本變得更為重要了.