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  • 已知基因名和cDNA位點,如何找到相對應(yīng)的DNA序列上的位點?

    已知基因名和cDNA位點,如何找到相對應(yīng)的DNA序列上的位點?
    例:已知基因名PLEC,NM_201384,exon1,c.14A>G.現(xiàn)在要驗證c.14A>G這個位點是否發(fā)生突變.我在NCBI中可以查到這個基因相對應(yīng)的mRNA的序列,可以以mRNA序列設(shè)計引物么?這對因為可以對gDNA進(jìn)行擴增么?c.14這個位點對應(yīng)到gDNA序列中是哪個位點?
    生物人氣:523 ℃時間:2020-05-23 23:22:25
    優(yōu)質(zhì)解答

    你找的14a在這里,通過上下游的堿基搜索就可以了.


    可以根據(jù)mRNA序列設(shè)計引物,擴增gDNA,但必須注意,引物必須在同一個exon上.如果擴增的片段跨了一個或幾個intron,還要用到long PCR的酶.


    有個比較簡單的方法,反轉(zhuǎn)錄mRNA,以cDNA為模板,就沒有上述的限制了.

    引物設(shè)計軟件,例如PP6,可以設(shè)定引物的位置
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