1、平面內(nèi)的一條直線把平面分為兩部分,其中的每一部分都叫做半平面,從一條直線出發(fā)的兩個(gè)半平面所組成的圖形,叫做二面角.(蛋白質(zhì)中的話一般用的比較多的是b折疊片、b轉(zhuǎn)角)
2、別構(gòu)效應(yīng)（allosteric effect）某種不直接涉及蛋白質(zhì)活性的物質(zhì),結(jié)合于蛋白質(zhì)活性部位以外的其他部位（別構(gòu)部位）,引起蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象變化,而導(dǎo)致蛋白質(zhì)活性改變的現(xiàn)象.
3、同源蛋白質(zhì)：在不同生物體內(nèi)行使相同或相似功能的蛋白質(zhì).
4、簡(jiǎn)單蛋白質(zhì)：水解后只產(chǎn)生氨基酸而不產(chǎn)生其他物質(zhì)的蛋白質(zhì).根據(jù)來(lái)源、受熱凝固性及溶解度等理化性質(zhì)的不同,分為白蛋白、球蛋白、谷蛋白、醇溶蛋白（有的寫成“谷醇溶蛋白”或“醇溶谷蛋白”）、組蛋白、魚精蛋白和硬蛋白等七類.
5、結(jié)合蛋白質(zhì)：?jiǎn)渭兊鞍踪|(zhì)和其他化合物結(jié)合構(gòu)成,被結(jié)合的其他化合物通常稱為結(jié)合蛋白質(zhì)的非蛋白部分(輔基).按其非蛋白部分的不同而分為核蛋白(含核酸)、糖蛋白(含多糖)、脂蛋白(含脂類)、磷蛋白(含磷酸)、金屬蛋白(含金屬)及色蛋白(含色素)等
6、天然蛋白質(zhì)因受物理的或化學(xué)的因素影響,其分子內(nèi)部原有的高度規(guī)律性結(jié)構(gòu)發(fā)生變化致使蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)和生物學(xué)性質(zhì)都有所改變,但不導(dǎo)致蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的破壞,這種現(xiàn)象稱為蛋白質(zhì)變性作用.
7、向某些蛋白質(zhì)溶液中加入某些無(wú)機(jī)鹽溶液后,可以使蛋白質(zhì)凝聚而從溶液中析出,這種作用叫作鹽析,可復(fù)原.
8、結(jié)構(gòu)域（Structural Domain）是介于二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)之間的另一種結(jié)構(gòu)層次.所謂結(jié)構(gòu)域是指蛋白質(zhì)亞基結(jié)構(gòu)中明顯分開的緊密球狀結(jié)構(gòu)區(qū)域,又稱為轄區(qū).多肽鏈?zhǔn)紫仁窃谀承﹨^(qū)域相鄰的氨基酸殘基形成有規(guī)則的二級(jí)結(jié)構(gòu),然后,又由相鄰的二級(jí)結(jié)構(gòu)片段集裝在一起形成超二級(jí)結(jié)構(gòu),在此基礎(chǔ)上多肽鏈折疊成近似于球狀的三級(jí)結(jié)構(gòu).對(duì)于較大的蛋白質(zhì)分子或亞基,多肽鏈往往由兩個(gè)或多個(gè)在空間上可明顯區(qū)分的、相對(duì)獨(dú)立的區(qū)域性結(jié)構(gòu)締合而成三級(jí)結(jié)構(gòu),這種相對(duì)獨(dú)立的區(qū)域性結(jié)構(gòu)就稱為結(jié)構(gòu)域.對(duì)于較小的蛋白質(zhì)分子或亞基來(lái)說(shuō),結(jié)構(gòu)域和它的三級(jí)結(jié)構(gòu)往往是一個(gè)意思,也就是說(shuō)這些蛋白質(zhì)或亞基是單結(jié)構(gòu)域.結(jié)構(gòu)域自身是緊密裝配的,但結(jié)構(gòu)域與結(jié)構(gòu)域之間關(guān)系松懈.結(jié)構(gòu)域與結(jié)構(gòu)域之間常常有一段長(zhǎng)短不等的肽鏈相連,形成所謂鉸鏈區(qū).不同蛋白質(zhì)分子中結(jié)構(gòu)域的數(shù)目不同,同一蛋白質(zhì)分子中的幾個(gè)結(jié)構(gòu)域彼此相似或很不相同.常見結(jié)構(gòu)域的氨基酸殘基數(shù)在100～400個(gè)之間,最小的結(jié)構(gòu)域只有40～50個(gè)氨基酸殘基,大的結(jié)構(gòu)域可超過400個(gè)氨基酸殘基.
9、由兩個(gè)或兩個(gè)以上亞基組成的蛋白質(zhì)統(tǒng)稱為寡聚蛋白質(zhì).
10、構(gòu)象：指一個(gè)分子中,不改變共價(jià)鍵結(jié)構(gòu),僅單鍵周圍的原子放置所產(chǎn)生的空間排布.一種構(gòu)象改變?yōu)榱硪环N構(gòu)象時(shí),不要求共價(jià)鍵的斷裂和重新形成.構(gòu)象改變不會(huì)改變分子的光學(xué)活性.
11、構(gòu)型：一個(gè)有機(jī)分子中各個(gè)原子特有的固定的空間排列.比如：正·異·順（Z）·反（E）·R·S·這種排列不經(jīng)過共價(jià)鍵的斷裂和重新形成是不會(huì)改變的.構(gòu)型的改變往往使分子的光學(xué)活性發(fā)生變化.分子中由于各原子或基團(tuán)間特有的固定的空間排列方式不同而使它呈現(xiàn)出不同的較定的立體結(jié)構(gòu),如D-甘油醛與 L-甘油醛,D-葡萄糖和L葡萄糖是鏈狀葡萄糖的兩種構(gòu)型,a-D-葡萄糖和b-D-葡萄糖是環(huán)狀葡萄糖的兩種構(gòu)型.一般情況下,構(gòu)型都比較穩(wěn)定,一種構(gòu)型轉(zhuǎn)變另一種構(gòu)型則要求共價(jià)鍵的斷裂、原子(基團(tuán))間的重排和新共價(jià)鍵的重新形成.
12、肽單位（peptide unit）又稱為肽基（peptide group）,肽鍵的所有四個(gè)原子和與之相連的兩個(gè)a-碳原子所組成的基團(tuán).是肽鍵主鏈上的重復(fù)結(jié)構(gòu).是由參于肽鏈形成的氮原子,碳原子和它們的4個(gè)取代成分：羰基氧原子,酰氨氫原子和兩個(gè)相鄰α-碳原子組成的一個(gè)平面單位.肽鏈中的酰胺基(-CO-NH-)稱為 肽基 (peptide group)或 肽單位（peptide unit).