①核酸為生物大分子，不屬于生命系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)層次；
②神經(jīng)元屬于細(xì)胞層次；
③呼吸道的上皮屬于上皮組織；
④病毒不屬于生命系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)層次；
⑤胃屬于器官層次；
⑥一只野兔屬于個(gè)體層次；
⑦同一片森林中的所有野兔屬于一個(gè)種群；
⑧一片草地中所有的昆蟲為多個(gè)種群，既不是種群，又不是群落；
⑨一片果園屬于一個(gè)生態(tài)系統(tǒng)．
能正確體現(xiàn)生命系統(tǒng)由簡(jiǎn)單到復(fù)雜層次的是②③⑤⑥⑦⑨．
故選：D．