根據(jù)酶所催化的反應(yīng)性質(zhì)的不同,將酶分成六大類：
氧化還原酶類（oxidoreductase）
　　促進(jìn)底物的氧化或還原.
轉(zhuǎn)移酶類（transferases）
　　促進(jìn)不同物質(zhì)分子間某種化學(xué)基團(tuán)的交換或轉(zhuǎn)移.
水解酶類（hydrolases ）
　　促進(jìn)水解反應(yīng).
裂合酶類（lyases）
　　催化從底物分子雙鍵上加基團(tuán)或脫基團(tuán)反應(yīng),即促進(jìn)一種化合物分裂為兩種化合物,或由兩種化合物合成一種化合物.
異構(gòu)酶類（isomerases）
　　促進(jìn)同分異構(gòu)體互相轉(zhuǎn)化,即催化底物分子內(nèi)部的重排反應(yīng).
合成酶類（ligase）
　　促進(jìn)兩分子化合物互相結(jié)合,同時(shí)ATP分子（或其它三磷酸核苷）中的高能磷酸鍵斷裂,即催化分子間締合反應(yīng). 　　按照國際生化協(xié)會(huì)公布的酶的統(tǒng)一分類原則,在上述六大類基礎(chǔ)上,在每一大類酶中又根據(jù)底物中被作用的基團(tuán)或鍵的特點(diǎn),分為若干亞類；為了更精確地表明底物或反應(yīng)物的性質(zhì),每一個(gè)亞類再分為幾個(gè)組（亞亞類）；每個(gè)組中直接包含若干個(gè)酶.