1.細(xì)胞：這里包括各種動(dòng)植物組織器官分離得到的細(xì)胞（在體也可觀察,比如觀察洋蔥表皮細(xì)胞,做成切片標(biāo)本等）；體外培養(yǎng)的動(dòng)植物細(xì)胞（比如癌細(xì)胞）；
2.微生物：這里包括各種細(xì)菌、真菌、病毒等等.
3.單細(xì)胞動(dòng)物：即原生動(dòng)物門中的單細(xì)胞動(dòng)物,像草履蟲等等.
4.單細(xì)胞植物：這主要指的就是單細(xì)胞的藻類,像小球藻等等.這里基本屬于浮游植物了（也有底棲）.
5.其他微小動(dòng)物：有些動(dòng)物門里的動(dòng)物個(gè)體非常微小,比如輪蟲等也需顯微鏡觀察.有些大型動(dòng)物的幼蟲也是非常小,需要顯微鏡觀察,比如海參的幼蟲.這些基本屬于浮游動(dòng)物了.
另外,顯微鏡技術(shù)發(fā)展很快,細(xì)胞內(nèi)的更加細(xì)微的結(jié)構(gòu),可以利用電子顯微鏡等更高級(jí)的顯微技術(shù)觀察到.