（1）∵兩種飲料每天共生產(chǎn)500瓶，每天生產(chǎn)甲種飲料x瓶，
∴每天生產(chǎn)乙種飲料（500-x）瓶，
根據(jù)題意得：y=3x+5（500-x）=-2x+2500；
∴y與x之間的函數(shù)關(guān)系式為y=-2x+2500；
（2）∵該廠每天投入的總成本不超過(guò)1800元，
∴-2x+2500≤1800，
∴x≥350，
∴少要安排生產(chǎn)甲種飲料350瓶；
（3）根據(jù)題意得：3x×20%+5（500-x）×37%≥（-2x+2500）×25%，
解得：x≤400，
由（1）投入的總成本為y=-2x+2500，
∵k=-2＜0，
∴y隨x增大而減小，
∴當(dāng)x=400時(shí)，y最小，y=-2×400+2500=1700，
∴每天生產(chǎn)甲種飲料400瓶，每天生產(chǎn)乙種飲料100瓶時(shí)，總成本最低，此時(shí)最低成本為1700元．