限制性核酸內(nèi)切酶（以下簡稱限制酶）：限制酶主要存在于微生物（細菌、霉菌等）中.一種限制酶只能識別一種特定的核苷酸序列,并且能在特定的切點上切割DNA分子.是特異性地切斷DNA鏈中磷酸二酯鍵的核酸酶（“分子手術刀”）.發(fā)現(xiàn)于原核生物體內(nèi),現(xiàn)已分離出100多種,幾乎所有的原核生物都含有這種酶.是重組DNA技術和基因診斷中重要的一類工具酶.例如,從大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)的一種限制酶只能識別GAATTC序列,并在G和A之間將這段序列切開.目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了200多種限制酶,它們的切點各不相同.蘇云金芽孢桿菌中的抗蟲基因,就能被某種限制酶切割下來.在基因工程中起作用.
DNA連接酶：主要是連接DNA片段之間的磷酸二酯鍵,起連接作用,在基因工程中起作用.
DNA聚合酶：主要是連接DNA片段與單個脫氧核苷酸之間的磷酸二酯鍵,在DNA復制中起做用.
DNA聚合酶只能將單個核苷酸加到已有的核酸片段的3′末端的羥基上,形成磷酸二酯鍵；而DNA連接酶是在兩個DNA片段之間形成磷酸二酯鍵,不是在單個核苷酸與DNA片段之間形成磷酸二酯鍵.
DNA聚合酶是以一條DNA鏈為模板,將單個核苷酸通過磷酸二酯鍵形成一條與模板鏈互補的DNA鏈；而DNA連接酶是將DNA雙鏈上的兩個缺口同時連接起來.因此DNA連接酶不需要模板.
RNA聚合酶（又稱RNA復制酶、RNA合成酶）的催化活性：RNA聚合酶以完整的雙鏈DNA為模板,轉錄時DNA的雙鏈結構部分解開,轉錄后DNA仍然保持雙鏈的結構.真核生物RNA聚合酶：真核生物的轉錄機制要復雜得多,有三種細胞核內(nèi)的RNA聚合酶：RNA聚合酶I轉錄rRNA,RNA聚合酶II轉錄mRNA,RNA聚合酶III轉錄tRNA和其它小分子RNA.在RNA復制和轉錄中起作用.
反轉錄酶：RNA指導的DNA聚合酶,具有三種酶活性,即RNA指導的DNA聚合酶,RNA酶,DNA指導的DNA聚合酶.在分子生物學技術中,作為重要的工具酶被廣泛用于建立基因文庫、獲得目的基因等工作.在基因工程中起作用.
解旋酶：是一類解開氫鍵的酶,由水解ATP來供給能量它們常常依賴于單鏈的存在,并能識別復制叉的單鏈結構.在細菌中類似的解旋酶很多,都具有ATP酶的活性.大部分的移動方向是5'→3',但也有3'→5'移到的情況,如n'蛋白在φχ174以正鏈為模板合成復制形的過程中,就是按3'→5'移動.在DNA復制中起做用.
DNA限制酶作用于磷酸二酯鍵
DNA連接酶作用于磷酸二酯鍵
DNA聚合酶作用于磷酸二酯鍵
DNA解旋酶作用于氫鍵