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  • 沒有完整的ORF是完整的基因么?如何設計引物

    沒有完整的ORF是完整的基因么?如何設計引物
    拼接得出的cDNA序列沒有完整的ORF(沒有終止密碼子),像這種情況的序列是完整的基因嗎?設計引物怎么設計?是根據全長序列設計引物呢,還是僅僅根據 ORF來設計?
    設計引物后就要做RT-PCR,然后膠回收再測序。
    其他人氣:184 ℃時間:2020-04-15 18:00:04
    優(yōu)質解答
    拼接的cDNA序列結果有可能會出現各種各樣的情況,沒有完整的ORF的話建議你去blast一下基因組序列(如果你所做的物種的基因組已經測的差不多的話),如果在基因組中能定位到的話就去用基因預測軟件預測基因組上的基因并找到外顯子,再拼出全長ORF,
    如果沒有基因組信息那就只能去做5'RACE和3'RACE了,如果能RACE出來經過測序鑒定和你接拼的序列一樣說明這個基因確實是存在的,如果RACE不到可能就是假基因,不過如果你是從EST庫中拼出來的應該不會是假基因,假基因不會存在于EST庫中.祝研究成功
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