對于每一個(gè)發(fā)酵過程而言,污染的雜菌種類的影響是不同的.如在抗生素的發(fā)酵過程中,青霉素的發(fā)酵污染細(xì)短產(chǎn)氣桿菌比粗大桿菌的危害更大；鏈霉素的發(fā)酵污染細(xì)短桿菌、假單胞桿菌和產(chǎn)氣桿菌比污染粗大桿菌更有危害；四環(huán)素的發(fā)酵過程最怕污染雙球菌、芽孢桿菌和夾膜桿菌；檸檬酸的發(fā)酵最怕青霉菌的污染；谷氨酸發(fā)酵最怕噬菌體污染.因噬菌體蔓延迅速,難以防治,容易造成連續(xù)污染.若污染的雜菌是耐熱的芽孢桿菌,可能是由于培養(yǎng)基或設(shè)備滅菌不徹底、設(shè)備存在死角等引起；若污染的是球菌、無芽孢桿菌等不耐熱雜菌,可能是由于種子帶菌、空氣過濾效率低、除菌不徹底、設(shè)備滲漏和操作問題等引起；若污染的是真菌,就可能是由于設(shè)備或冷卻盤管的滲漏（一般是淺綠色菌落）、無菌室滅菌不徹底或無菌操作不當(dāng)（一般是霉菌）、糖液滅菌不徹底(特別是糖液放置時(shí)間較長)而引起.