MHC分子作為代表個(gè)體特異性的主要組織抗原,在排斥反應(yīng)中起重要作用.MHC的主要功能包括：
　　（1）參與對(duì)抗原處理：MHC分子在多個(gè)環(huán)節(jié)參與對(duì)抗原處理.外源性抗原在APC內(nèi)被降解成免疫原性多肽,并與MHC-II類分子結(jié)合成穩(wěn)定的復(fù)合物,從而保證了多肽不被進(jìn)一步降解為氨基酸.
　?。?）約束免疫細(xì)胞間的相互作用：具有同一MHC表型的免疫細(xì)胞才能有效地相互作用,稱為MHC限制性（MHC restriction）.巨噬細(xì)胞與TH細(xì)胞間的相互作用受MHC-II類抗原的約束.只有MHC-II類分子陽(yáng)性細(xì)胞才具有抗原呈遞能力,且細(xì)胞表面II類分子密度與其抗原呈遞能力呈正相關(guān).Tc與病毒感染的靶細(xì)胞間相互作用受MHC-I類抗原的約束.
　　（3）參與對(duì)免疫應(yīng)答的遺傳控制：機(jī)體對(duì)某種抗原物質(zhì)是否產(chǎn)生應(yīng)答以及應(yīng)答的強(qiáng)弱是受遺傳控制的.控制免疫應(yīng)答的基因稱為Ir基因,一般認(rèn)為位于HLA-II類基因區(qū)內(nèi).
　?。?）誘導(dǎo)自身或同種淋巴細(xì)胞反應(yīng)：MHC分子可作為自身或同種反應(yīng)的刺激分子從而誘導(dǎo)免疫應(yīng)答或參與免疫調(diào)節(jié).
　?。?） 參與T細(xì)胞分化過程：早期T細(xì)胞在胸腺中發(fā)育為成熟T細(xì)胞的過程中,伴隨著一系列表面標(biāo)志的變化.MHC分子對(duì)T細(xì)胞的分化發(fā)育起著重要作用,早期T細(xì)胞必須與表達(dá)MHC-I或II類抗原的胸腺上皮細(xì)胞接觸才能分別分化成CD8+或CD4+T細(xì)胞.