MHC-I類分子的重要生理功能是對cd8t細(xì)胞的抗原識別功能起限制性作用,也就是參與向cd8t細(xì)胞遞呈抗原的過程.cd8t細(xì)胞只能識別與相同ⅰ類分子結(jié)合的抗原（多為內(nèi)源性的細(xì)胞抗原,如病毒感染的細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞等）,這種現(xiàn)象稱為mhc限制性.例如,當(dāng)病毒感染了某個細(xì)胞,病毒抗原可被分解成一些短肽片段,后者與在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中合成的ⅰ類分子結(jié)合后表達(dá)于細(xì)胞表面,才能被cd8t細(xì)胞識別.ⅰ類分子主要介導(dǎo)tc細(xì)胞的細(xì)胞毒作用,也是重要的移植抗原.
MHC-II類分子的功能主要是在免疫應(yīng)答的始動階段將經(jīng)過處理的抗原片段遞呈給cd4t細(xì)胞.正如cd8t細(xì)胞只能識別與mhcⅰ類分子結(jié)合的抗原片段一樣,cd4t細(xì)胞只能識別ⅱ類分子結(jié)合的抗原片段.ⅱ類分子主要參與外源性抗原的遞呈,在一些條件下也可遞內(nèi)源性抗原.在組織或器官移植過程中,ⅱ類分子是引起移植排斥反應(yīng)的重要靶抗原,包括引起宿主抗移植物反應(yīng)（hvgr）和移植物抗宿主反應(yīng)（gvhr）.在免疫應(yīng)答中,ⅱ類抗原主要是協(xié)調(diào)免疫細(xì)胞間的相互作用,調(diào)控體液免疫和細(xì)胞免疫應(yīng)答.