從細(xì)胞結(jié)構(gòu)上看,原生動(dòng)物的單細(xì)胞相似于多細(xì)胞動(dòng)物身體中的一個(gè)細(xì)胞,也可以區(qū)分成細(xì)胞質(zhì)及細(xì)胞核,細(xì)胞質(zhì)表面有細(xì)胞膜包圍.從機(jī)能上看,（原生動(dòng)物）細(xì)胞又是一個(gè)完整的有機(jī)體,它能完成多細(xì)胞動(dòng)物所具有的生命機(jī)能,例如營(yíng)養(yǎng)、呼吸、排泄、生殖及對(duì)外界刺激產(chǎn)生反應(yīng),這些機(jī)能由細(xì)胞或由細(xì)胞特化而成的細(xì)胞器來執(zhí)行.所以不同的細(xì)胞器在機(jī)能上相當(dāng)于多細(xì)胞動(dòng)物體內(nèi)的器官及系統(tǒng).它們是在不同的結(jié)構(gòu)水平上執(zhí)行著相同的生理機(jī)能.原生動(dòng)物在結(jié)構(gòu)與機(jī)能上分化的多樣性及復(fù)雜性是多細(xì)胞動(dòng)物中任何一個(gè)細(xì)胞無法比擬的,所以從細(xì)胞水平上說,構(gòu)成原生動(dòng)物的細(xì)胞是分化最復(fù)雜的細(xì)胞.極少數(shù)原生動(dòng)物是由幾個(gè)或許多個(gè)細(xì)胞組成,細(xì)胞之間沒有形態(tài)與機(jī)能的分化,也可能出現(xiàn)了初步的形態(tài)機(jī)能分化,但每個(gè)細(xì)胞仍然保持著一定的獨(dú)立性,這類原生動(dòng)物稱為群體,例如盤藻、雜球藻等.