如何利用RG3000和MX3000P兩款熒光定量pcr儀進(jìn)行相對定量數(shù)據(jù)分析
如何利用RG3000和MX3000P兩款熒光定量pcr儀進(jìn)行相對定量數(shù)據(jù)分析
生物人氣:388 ℃時間:2020-09-30 22:39:51
優(yōu)質(zhì)解答
(1)分頁:將不同的引物(基因)分在不同的頁;(2)將來自相同模板的名字一樣,可以定義為1234...;例如:P1(引物)P2P3P4WT:calibratorActin(1)A(1)B(1)C(1)MT1:unknown1Actin(2)A(2)B(2)C(2)MT2:unknown2Actin(3)A(3)B(3)C(3) 說明:(1)P1:引物1,擴(kuò)增相同的基因;(2)WT:calibrator 對照組樣本,例如:野生型WT(Wild type);(3)MT:unknown 未知組樣本或處理組樣本或待測組樣本,例如突變型MT(Mutant type).數(shù)據(jù)分析時,選用Quantation 直接出原始圖;選用2-△△Ct方法,然后根據(jù)提示選擇:Analysis - Others - Delta Delta CT Relative Quatatition - validation performed、Gene Interest Quantitation 、Normalizer Quantitation 和Calibrator Defined 出相對定量柱狀圖;選擇2 Standard Curves Relative Quantitation ,然后根據(jù)提示選擇:Gene Interest StandardCurve、Normalizer Stard Curve和Calibrator Defined 出相對定量柱狀圖.2、MX3000P熒光定量PCR儀:軟件:MxPro根據(jù)樣本來源和待擴(kuò)增基因分類如下:Assoc.symbolSample:樣本來源NormalizerGene of InterestGene of InterestAWT(Calibrator對照組)ActinGene1Gene2BMT1 (unknown1待測組)ActinGene1Gene2CMT2 (unknown2待測組)ActinGene1Gene2DMT3 (unknown3待測組)ActinGene1Gene2EMT4 (unknown4待測組)ActinGene1Gene2操作步驟:進(jìn)入軟件主頁 --- 選擇“comparative quantitation” --- well type 選擇(Calibrator:如WT;Unknown:如MT)--- 選擇:sybr / reference:rox --- 選擇Normalizeing assay(看家/內(nèi)參基因組) --- 然后將選擇Assoc.symbol將相同樣本來源的樣品孔綁定起來;擴(kuò)增程序設(shè)計;結(jié)果分析:選定Calibrator 和 Unknown組的內(nèi)參基因和感興趣基因,結(jié)果分析即可得到柱狀圖.
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