1.前者是中性的,后者是帶負電
前者是官能團,是整體的一部分；而后者是獨立性強~常常本身就是整體；前者不可單獨存在~后者可以單獨獨在.
2.常以為把羥基從母體上(假定)分離后,羥基是帶有單電子的基團,氫氧根內電子都成雙.
3.在氫氧根做配體形成的配合物中,氫氧根也讀作羥基,如,Al(OH)3(讀作氫氧化鋁)+OH-=
Al(OH)4-,Al(OH)4-(讀作四羥基合鋁（III））.
4.有時是不仔細區(qū)分是羥基還是應該是氫氧根,如氫氧化鎂,有時說‘其中的氧是羥基氧’-并不是說‘其中的氧是氫氧根的氧’.總之約定俗成了.